Bon coup étudiant : Fanny Fronton publie un article dans la revue Scientific Reports

Félicitation à Fanny Fronton doctorante à l’INRS sous la direction d’Yves St-Pierre pour la publication de son article scientifique dans la revue Scientific Reports intitulé “Insights into the circulating microbiome of the Atlantic and Greenland halibut populations: the role of species-specific and environmental factors”.

Résumé:

La mise en place de programmes de surveillance à long terme basés sur les microbiomes est essentielle pour la gestion et la conservation des populations de poissons sauvages en réponse au changement climatique. Dans la plupart des cas, ces études ont été menées sur les microbiomes intestinaux et, dans une moindre mesure, sur les microbiomes dermiques (mucus). Ici, nous avons exploité le concept de biopsie liquide pour étudier le microbiome bactérien circulant de deux espèces de flétan d’importance économique et écologique. L’amplification et le séquençage du gène de l’ARNr 16S ont été réalisés à partir d’une seule goutte de sang fixée sur des cartes FTA™ afin d’identifier le microbiome sanguin des populations de flétan de l’Atlantique, Hippoglossus hippoglossus (Linnaeus, 1758), et du Groenland, Reinhardtius hippoglossoides (Walbaum, 1792), vivant dans le golfe du Saint-Laurent, au Canada. Nous apportons la preuve que l’ADN du microbiome circulant (cmDNA) est influencé par des facteurs spécifiques à l’espèce et des facteurs environnementaux. Plus précisément, nous avons constaté que les signatures du microbiome circulant sont spécifiques à l’espèce et varient en fonction du sexe, de la taille, de la température, du facteur de condition et de la localisation géographique. Dans l’ensemble, notre étude fournit une nouvelle approche pour la détection des signatures dysbiotiques et le risque de maladie dans les populations de poissons sauvages pour la gestion des pêcheries, plus particulièrement dans le contexte du changement climatique.

Pour lire et retrouver l’article de Fanny :

https://www.nature.com/articles/s41598-023-32690-6