Nos membres rayonnent – Joséphine Michelot réalise une mission de recherche en Amazonie dans le cadre de son doctorat

Le RAQ est fier de souligner le parcours de sa membre Joséphine Michelot, étudiante au doctorat en biologie à l’Université Laval sous la direction du professeur Nicolas Derome, qui a réalisé une mission de terrain en Amazonie brésilienne dans le cadre de ses travaux de recherche.

Grâce au soutien financier du RAQ, du Fonds de recherche du Québec (FRQ) et de l’Université Laval, Joséphine a effectué une campagne d’échantillonnage essentielle à l’avancement de son projet doctoral portant sur l’impact du microbiote sur l’épigénome et les éléments transposables impliqués dans l’adaptation rapide de poissons amazoniens à des environnements extrêmes.

Une recherche au cœur des écosystèmes amazoniens

Le projet de doctorat de Joséphine s’intéresse à la façon dont le microbiote pourrait influencer les mécanismes génétiques favorisant l’adaptation de téléostéens amazoniens aux conditions physicochimiques particulières du Rio Negro, un milieu caractérisé par une faible teneur en ions, un pH très acide et d’importantes variations saisonnières liées aux cycles d’inondation.

Pour répondre à ses objectifs de recherche, elle s’est rendue en Amazonie brésilienne afin de réaliser des prélèvements sur deux espèces modèles :

• Le cichlidé drapeau (Mesonauta festivus), une espèce prisée dans le domaine de l’aquariophilie;
• Le piranha noir (Serrasalmus rhombeus), pêché pour la consommation humaine.

Les travaux ont été effectués sur trois sites d’échantillonnage distincts :

• Rio Urubu;
• Lago do Cemitério;
• Parc national d’Anavilhanas.

Une expérience de terrain exigeante et formatrice

La collecte des spécimens a nécessité l’adaptation des méthodes de capture selon les espèces ciblées. Les cichlidés étaient repérés de nuit puis capturés délicatement à l’épuisette, tandis que les piranhas étaient prélevés à l’aide de lignes ou de filets avec le soutien de pêcheurs professionnels locaux.

Cette mission a permis à Joséphine de développer plusieurs compétences techniques liées à la recherche en milieu naturel, notamment :

• La manipulation de poissons sauvages;
• Les dissections et prélèvements de tissus;
• La préparation et la conservation d’échantillons biologiques;
• L’organisation d’un espace de travail fonctionnel dans des conditions de terrain variables.

Les tissus recueillis comprenaient entre autres les branchies, le foie, le tube digestif, la muqueuse épidermique, les otolithes et les nageoires, autant d’échantillons qui seront utilisés pour les analyses prévues dans le cadre de son doctorat.

Une collaboration internationale enrichissante

Au-delà des aspects scientifiques, cette mission a également permis à Joséphine de travailler étroitement avec les chercheurs de l’Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) ainsi qu’avec des pêcheurs locaux.

Cette collaboration a joué un rôle clé dans la réussite des activités de terrain. Les connaissances du milieu, des espèces et des techniques de pêche détenues par les partenaires brésiliens ont grandement contribué au bon déroulement des opérations et à la sécurité des équipes sur le terrain.

Pour Joséphine, cette expérience a également mis en lumière l’importance de la collaboration internationale, du partage des savoirs et de l’adaptation des protocoles scientifiques aux réalités locales.

Une étape importante dans son parcours doctoral

Cette mission en Amazonie représente une étape marquante dans le cheminement académique de Joséphine Michelot. En plus de lui permettre d’acquérir de nouvelles compétences techniques et logistiques, elle lui a offert une meilleure compréhension des liens entre les organismes étudiés et leur environnement naturel complexe.

Les échantillons récoltés contribueront à faire progresser les connaissances sur les mécanismes d’adaptation des poissons amazoniens et sur le rôle potentiel du microbiote dans ces processus.

Le RAQ félicite Joséphine Michelot pour cette expérience de recherche remarquable et lui souhaite beaucoup de succès dans la poursuite de son doctorat.